Nature-plant (nature communication)

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• Nature plant |华中农大和南边科技大学提醒蓝光受体CRY2激活的分子机制
• 钻研停顿 | 带你搭上单倍型基因组钻研的慢车
• 作物遗传改良国度重点试验室（华中农业大学）的钻研方向

Nature plant |华中农大和南边科技大学提醒蓝光受体CRY2激活的分子机制

在植物成长与发育的精细调控中，光受体起着关键作用。

隐花样素家族，如CRY1和CRY2，它们在蓝光信号的传递中表演着选择性的角色。

在拟南芥中，CRY2尤其在调控花分化和光周期效应中展现共同作用，同时影响着昼夜节律、气孔调控、根系发育和多种植物照应机制，包含避光反响和叶片苍老环节。

CRY蛋白结构中，N端的PHR结构域和C端的CCE结构域是其外围。

PHR进一步分为α/β和α亚结构域，其中α亚结构域与FAD非共价结合。

在蓝光照耀下，FAD教训克恢复，构成FAD自在基。

CRY2的寡聚化环节则在光照耀下增强，这使得它能更有效地结合下游转录因子，如CIBs、PIF4和PIF5，进而调控基因表白。

虽然CRY光激活的钻研取得清楚停顿，但关于如何失活的机制，如BIC-CRY复合体的汇集和BIC克服机制，咱们仍知之甚少。

2020年，科研界的一大亮点是华中农业大学作物遗传改良国度重点试验室和生命迷信技术学院殷平传授团队与南边科技大学龚欣传授团队的联结钻研，他们于Nature Plants宣布了一篇题为《Structural insights into the photoactivation of Arabidopsis CRY2》的论文，对BIC介导的CRY2失活提供了深入的分子了解，并为CR

钻研停顿 | 带你搭上单倍型基因组钻研的慢车

单倍型基因组钻研：提醒遗传微妙与退化门路

在动物学的前沿畛域，单倍型基因组钻研正以史无前例的速度推动，为了解遗传负荷、驯化机制和物种演变提供了全新的视角。

传统的组装战略如Trio-binning虽有其局限性，但DipAsm结合Hi-C技术的产生，处置了杂合区的难题。

Hifiasm以其高效性和简化流程，已成为泛滥钻研者的首选工具。

特意是关于多倍体，PolyGembler/nPhase的处置战略，虽然须要家系或后人序列的允许，但为提醒复杂遗传结构提供了关键线索。

经过PacBio、Illumina和Hi-C的联结运行，一项茶树基因组钻研构建出TGY基因组，其大小约为3.15 Gb，杂合度仅为2.31%。

经过单倍型拆分与定相，咱们提醒了15对假染色体和5.98 Gb的锚定序列，其中等位基因变异和表白差异与茶叶质量关系的基因严密关系。

进一步的剖析深化到等位基因结构、表白形式和选用压力，探求基因配置在驯化环节中的关键作用。

在荔枝基因组钻研中，发现了一个繁多全基因组三倍化现象，家养和栽培种类的变异提供了丰盛的驯化参考。

等位基因差异表白剖析提醒了14,000个稳固差异表白基因，这些DEAs与转录因子和进行子区变异相互影响，间接指向了种类个性的遗传基础。

图3、4显示，LITCHI基因在开花期间和种质差异中表演关键角色，它的表白调控提醒了种类多样性的遗传机制。

钻研论断中，咱们强调了PacBio+Illumina+Hi-C+10x技术在提醒驯化基因组资源中的关键作用，尤其是在分子育种和基因组选用中的运行，为培养多样化荔枝种类提供了有力的迷信依据。

在生姜基因组钻研中，面对资源匮乏的应战，咱们应用PacBio+Illumina+Hi-C战略，提醒了生姜基因组的1.59 Gb大小，以及单倍型1和单倍型0的共同结构。

虽然存在3.78%的杂合率，但经过发育阶段的DEGs剖析，咱们关联了姜辣素积攒与基因表白的灵活变动，这为姜辣素动物分解钻研和种类改良提供了基础消息。

单倍型基因组作为基因组比拟和退化钻研的切入点，结合转录组学与代谢组学的深度剖析，为咱们提醒了生姜基因组的退化轨迹和动物分解机制。

援用的文献，如Li等人(2021)的上班，进一步强化了单倍型基因组在动物学钻研中的关键位置。

作物遗传改良国度重点试验室（华中农业大学）的钻研方向

（1）基因图谱钻研；（2）关键基因分别克隆钻研；（3）配置基因组钻研；（4）雄性不育与杂种长处钻研；（5）种质资源翻新及遗传多样性钻研；（6）分子技术育种钻研；（7）新种类选育。

近5年停顿：试验室面向我国农业开展的严重需求，以作物遗传改良钻研为方向，方向明白，特征显明，常年百折不挠；以关键作物为钻研对象，从配置基因组钻研到种类培养、示范推行，构成了上中下游一体“顶天立地”的钻研格式。